WCG - Smash Childhood Cancer - Mise à jour de janvier / février
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Des tests en laboratoire ont commencé pour plusieurs médicaments candidats susceptibles de cibler des protéines qui jouent un rôle dans certains cancers infantiles.
Contexte
L'équipe de recherche du projet Smash Childhood Cancer a identifié des protéines et d'autres molécules qui jouent un rôle clé dans certains cancers infantiles. L'enjeu est maintenant de trouver des candidats-médicaments chimiques qui ciblent spécifiquement ces molécules clés et contrôlent donc les cellules cancéreuses.
Décider de la prochaine cible du projet
L'équipe de recherche a une liste de cibles potentielles supplémentaires qui peuvent être importantes dans le développement de divers cancers infantiles. Ils procèdent actuellement à une revue de la littérature existante sur ces cibles. Il s'agit d'une première étape pour réduire la liste originale et pour aider les chercheurs à décider sur quoi se concentrer ensuite.
Analyse des données
L'équipe de recherche continue d'analyser les données des lots de travaux précédents exécutés sur World Community Grid.
Vous trouverez ci-dessous les protéines clés qui ont été examinées jusqu'à présent et pour lesquelles nous avons de nouvelles mises à jour. Chaque protéine répertoriée est impliquée dans le développement d'au moins un type de cancer infantile.
- Bêta caténine : À la fin de l'année dernière, les chercheurs ont identifié un composé qui pourrait être efficace pour cibler cette protéine. Ce composé est actuellement en cours de test.*
- Ostéopontine : Les tests ont maintenant commencé sur plusieurs composés qui pourraient être efficaces pour cibler cette protéine.*
- PAX3 : FOX01 : À la fin de l'année dernière, les chercheurs ont identifié un composé qui pourrait être efficace pour cibler cette protéine, et les tests en laboratoire ont maintenant commencé pour le composé.*
* Les tests d'efficacité des composés en laboratoire nécessitent généralement plusieurs phases, et chaque phase peut prendre au moins plusieurs mois.
État actuel des unités de travail
Projet suspendu
23 févr. 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=685
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WCG - Africa Rainfall Project : Mise à jour de janvier / février
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Les chercheurs continuent de promouvoir le projet tout en élaborant des plans pour l'analyse des données.
Contexte du projet
Dans le cadre du projet Africa Rainfall Project, des chercheurs de l'Université de technologie de Delft créent des simulations informatiques à haute résolution de tempêtes de pluie localisées en Afrique subsaharienne. Grâce à la puissance de calcul massive et participative de World Community Grid, ils peuvent exécuter des simulations à une résolution beaucoup plus élevée, exactement ce qui est nécessaire pour les orages localisés. Cela n'a jamais été fait pour les orages dans cette région.
Ceci est important car 95 % de l'agriculture en Afrique dépend des précipitations. Le projet utilise les données générées par le World Community Grid, les données de The Weather Company et d'autres informations pour fournir des prévisions de précipitations plus précises, ce qui aidera les agriculteurs à mieux cultiver.
Mise à jour du projet des chercheurs
N'oubliez pas de consulter cette mise à jour qui nous a été remise par l'équipe de recherche en décembre. La mise à jour comprend des informations sur la dernière présentation du chercheur principal sur le projet, ainsi que leurs plans pour les énormes quantités de stockage nécessaires pour les données du projet.
Présentation à venir
Camille Le Coz, membre de l'équipe de recherche, a récemment été acceptée en tant que présentatrice à l' Assemblée générale de l'EGU 2021, une conférence virtuelle pour l'Union européenne des géosciences. La conférence est actuellement prévue pour la fin avril.
État actuel des unités de travail
World Community Grid envoie actuellement la génération 50.
(Une génération est un ensemble de travaux - dans ce cas, un ensemble de simulations informatiques des précipitations en Afrique subsaharienne.)
18 févr. 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=684
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WCG - Mapping Cancer Markers : Mise à jour janvier / février
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Le travail se poursuit sur un article à propos des marqueurs du cancer du poumon.
Membres du Jurisica Lab , les chercheurs derrière Mapping Cancer Markers
Contexte
Mapping Cancer Markers vise à identifier les marqueurs associés à différents types de cancer. Le projet analyse des millions de points de données collectés à partir de milliers d'échantillons de tissus de patients sains et cancéreux. Ceux-ci comprennent les tissus atteints de cancer du poumon, de cancer de l'ovaire et de sarcome.
Jusqu'à présent, le projet a terminé d'exécuter des données sur le cancer du poumon et les marqueurs du cancer de l'ovaire sur le World Community Grid. Les chercheurs étudient actuellement les marqueurs du sarcome, qui est un groupe de cancers qui commencent dans les os, les muscles ou d'autres tissus. Vous pouvez en savoir plus sur les résultats de l'équipe de recherche à ce jour ici.
Article sur les marqueurs du cancer du poumon
L'équipe de recherche commence à finaliser une ébauche de son article et continue à y travailler avec certains de ses collègues cliniciens.
État actuel des unités de travail
- Disponible pour téléchargement : 654 lots
- En cours : 1175 lots (10.062.542 unités de travail)
- Terminé : 69.806 lots
1186 lots au cours des 30 derniers jours
- Moyenne de 39,53 lots par jour
- Reste-à-faire estimé : 16,5 jours
16 févr. 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=683
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WCG - Microbiome Immunity Project : Mise à jour de janvier / février
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Les scientifiques continuent de travailler sur des articles liés à la recherche en cours sur le World Community Grid.
Contexte
Des milliards de bactéries vivent à l'intérieur et sur notre corps. Le projet Microbiome Immunity Project utilise la puissance de calcul du World Community Grid pour étudier les protéines produites par ces bactéries, qui sont codées dans leurs génomes. Cela peut aider les scientifiques à comprendre le rôle du microbiote dans la maladie.
Jusqu'à présent, les chercheurs ont exécuté plus de 300 000 séquences de protéines dans leur plan de travail et ils ont encore plus de séquences à exécuter à l'avenir.
Articles en cours
La discussion de ce mois-ci s'est principalement concentrée sur trois articles qui se trouvent à différentes étapes du processus de création :
- Article 1 : Les chercheurs analysent plusieurs ensembles de données pour cet article (au moins trois).
- Article 2 : Les chercheurs attendent les résultats de 11 ensembles de données du World Community Grid pour poursuivre le processus d'analyse des données pour cet article.
- Article 3 : Cet article a été soumis pour examen à une revue universitaire. (Depuis le début de la pandémie, le processus d'examen prend un peu plus de temps que d'habitude.
État actuel des unités de travail
- Disponible pour téléchargement : 6 595 lots
- En cours : 3395 lots (6111703 unités de travail)
- Terminé : 326288 lots (1247 lots au cours des 30 derniers jours, soit une moyenne de 41,6 lots par jour)
- Reste-à-faire estimé : 158,5 jours
11 févr. 2021
traduction de l'article de WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=681
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WCG - OpenPandemics - COVID-19 : Mise à jour janvier/février
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Des tests en laboratoire ont commencé pour certains des composés prometteurs identifiés avec l'aide de volontaires du World Community Grid.
Contexte
OpenPandemics - COVID-19 a été créé pour aider à accélérer la recherche de traitements potentiels COVID-19. Le projet vise également à créer une boîte à outils open source à réponse rapide qui aidera tous les scientifiques à rechercher rapidement des traitements en cas de futures pandémies.
Fin 2020, les chercheurs ont annoncé avoir sélectionné 70 composés (parmi un groupe initial d'environ 20.000) qui pourraient être prometteurs d'être étudiés en tant qu'inhibiteurs potentiels du virus responsable du COVID-19.
Premier ensemble de composés soumis à des tests en laboratoire
Sur le groupe de 70 mentionnés ci-dessus, les chercheurs ont commandé et envoyé récemment les 25 premiers composés prometteurs à leurs collaborateurs de laboratoire, et le processus de test en laboratoire a commencé. Nous informerons tout le monde une fois que nous aurons des mises à jour sur les résultats des tests biologiques.
OpenPandemics pour GPU
Le processus de portage du code de l'application de recherche sur le GPU est en cours, car nous travaillons pour garantir que les unités de travail fonctionnent correctement et en toute sécurité avant d'être envoyées aux volontaires. La revue de sécurité du code est terminée.
État actuel des unités de travail
- Disponible pour téléchargement : 6 025 lots
- En cours : 2 528 lots (17 384 490 unités de travail)
- Terminé : 30576 lots
3098 lots au cours des 30 derniers jours
- Moyenne de 103 lots par jour
- Reste-à-faire estimé: 58 jours
4 févr. 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=680
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WCG - Mapping Cancer Markers : Mise à jour de décembre
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Les chercheurs et l'équipe technique de World Community Grid continuent de travailler ensemble pour développer de nouvelles unités de travail sur le sarcome.
Contexte
Mapping Cancer Markers vise à identifier les marqueurs associés à différents types de cancer. Le projet analyse des millions de points de données collectés à partir de milliers d'échantillons de tissus de patients sains et cancéreux. Ceux-ci comprennent les tissus atteints de cancer du poumon, de cancer de l'ovaire et de sarcome.
Jusqu'à présent, le projet a terminé d'exécuter des données sur le cancer du poumon et les marqueurs du cancer de l'ovaire sur le World Community Grid. Les chercheurs étudient actuellement les marqueurs du sarcome, qui est un groupe de cancers qui commencent dans les os, les muscles ou d'autres tissus. Vous pouvez en savoir plus sur les résultats de l'équipe de recherche à ce jour, ici.
Mise à jour détaillée du projet par les chercheurs
Plus tôt ce mois-ci, nous avons publié une mise à jour directement de l'équipe de recherche, que vous pouvez lire ici . Dans cet article, l'équipe explique comment un changement de code relativement petit pourrait avoir un impact important sur la capacité du projet à analyser des marqueurs pour différents types de sarcome.
Poursuite du perfectionnement des nouvelles unités de travail sur les sarcomes
L'équipe de recherche a terminé l'analyse des résultats des tests bêta pour les nouvelles unités de travail sur le sarcome. Ils ont trouvé quelques différences mineures entre leurs propres unités de travail de test et celles qui étaient exécutées sur World Community Grid. L'équipe technique de World Community Grid étudie ces différences. En attendant, il y aura beaucoup de travail disponible avec les unités de sarcome existantes.
État actuel des unités de travail
- Disponible pour téléchargement : 799 lots
- En cours : 1066 lots (64 982 542 unités de travail)
- Terminé : 68465 lots
1007 lots au cours des 30 derniers jours
Moyenne de 33,6 lots par jour
- Reste-à-faire estimé : 23 jours.
29 déc. 2020
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=678
- Affichages : 936
- WCG - Help Stop TB : Mise à jour de décembre
- WCG - Africa Rainfall Project planifie le stockage et le partage des données
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