Une nouvelle application devrait être lancée en 2010 sur le projet Leiden Classical, elle permettra de modéliser les phonons dans des phénomènes de diffusion de l'hydrogène sur des surfaces métalliques.

Les phonons, ou vibrations collectives d'un ensemble d'atomes en interactions, représentent un des aspects les plus importants de la physique des solides. Ils interviennent dans des propriétés aussi diverses que la propagation d'ondes sonores, la chaleur spécifique, la conductivité thermique et électrique, la supraconduvité, la ferroélectricité. On peut comprendre l'existence de telles vibrations à partir des interactions de chaque atomes avec ses voisins : si on impose localement, à la surface par exemple, un mouvement perturbateur qui déplace un certain nombres d'atomes de leur position d'équilibre, ceux ci agissent sur leurs voisins, et la perturbation locale de départ s'étend de proche en proche au solide tout entier sous forme d'un mouvement collectif (définition de l'Encyclopédie Universalis).