Depuis son lancement (le 21 Août 2007), le projet "Ensemble découvrons un médicament contre la dengue" (Discovering Dengue Drugs - Together) a permis de réunir l'équivalent de 6.500 années de calcul d'un ordinateur moyen. Près de 20 millions d'unités ont été calculées, ce qui représente le tiers de la totalité des calculs qu'il faudra effectuer sur ce projet. A ce rythme le projet pourrait se terminer dans un peu moins de 2 ans, en mars 2010.

Les scientifiques du projet sont extrêmement reconnaissant envers les particuliers qui offrent généreusement leur puissance de calcul inutilisée pour aider à trouver un traitement contre la dengue, l'hépatite C et le virus du Nil occidental.

Un criblage virtuel a été effectué entre une chimiothèque de 2,2 millions de macromolécules biologiques et la trypsine (référence 1EB2 dans la banque de données sur les protéines du Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, Protein Data Bank). Ce test permet un contrôle négatif des inhibiteurs découvert. (unités 401)

Une protéase de l'hépatite C a été utilisée comme une cible pour le criblage virtuel de composés "lead-like" et "drug-like" toujours par rapport à la même chimiothèque composée de 2,2 millions de macromolécules biologiques. Ces calculs (regroupés sous le nom de 0501) ont duré 2 mois.

Le calcul des premières unités analysant de véritables données scientifiques s'est terminé plutôt rapidement. Au cours de la semaine qui vient de s'écouler, les scientifiques du projet ont développé les outils qui permettront de produire les résultats et de les analyser. Ils sont extrêmement enthousiasmé par les chiffres obtenus. Bien que préliminaire, il semble que la nouvelle stratégie de recherche pourrait sensiblement améliorer le taux de détection des objets géocroiseurs (corps célestes susceptibles à un moment ou à un autre de croiser à proximité de la Terre). L'amélioration du taux de détection surpasserait même les meilleures projections qui avaient été faites au début du projet. Il faudra effectuer davantage de tests et de vérifications pour confirmer ces premières conclusions. Ce sera l'objectif des prochaines unités de calcul : plusieurs vagues de 1.000 à 2.000 unités de calcul seront envoyées la semaine prochaine.
Orbit@home est maintenant considéré comme un projet en phase de bêta test avancé (les utilisateurs BOINC les moins expérimentés peuvent maintenant rejoindre le projet et calculer des unités sans rencontrer de problèmes majeurs). Le travail sur une application intégrant un écran de veille, qui représentera graphiquement et en temps réel les calculs effectués par votre ordinateur, ne débutera pas avant le mois d'Août 2008 (voir cette vidéo de 13mn, 30,5 Mo, qui présente une session ORSA, Orbit@home utilisera cette même interface graphique).
Davantage de détails seront rendus public à l'issue de la conférence ACM2008 (la 10 ème conférence Astéroïdes, Comètes, Météores qui se tiendra du 13 au 17 Juillet à Baltimore dans le Maryland). Ce rassemblement est organisé par le laboratoire de physique appliqué de l'université Johns Hopkins. L'événement est sponsorisé par la NASA, le Lunar and Planetary Institute de Houston, le Jet Propulsion Laboratory, le Planetary Science Institute de Tucson et l'entreprise Lockheed Martin.
Pascale Tricario présentera les résultats obtenus le jeudi 17 Juillet à 16h15 au cours de la conférence "scoping out the rowdy neighbors : NEO surveys and hazards" ("observer les voisins dérangeants : Surveillance et évaluation des risques d'impact avec un géocroiseur").
Plus de détails sur la stratégie de recherche sont donnés dans cet article : "Numerical Simulations of Efficient Search Strategies for Near Earth Objects Surveys" (en anglais)

La série de challenges PrimeGrid se poursuit avec le "défi anniversaire" (Birthday Challenge) qui permettra de célébrer les 3 ans du projet PrimeGrid. Le challenge de 24 heures se déroulera sur la plus ancienne application encore en activité sur PrimeGrid, c'est à dire l'application Twin Prime Search (la recherche de nombres premiers jumeaux). La cerise sur le gâteau serait de découvrir deux nombres premiers jumeaux le jour même de l'anniversaire du projet.

Pour participer, il vous suffit de rejoindre le projet PrimeGrid et de sélectionner le projet Twin prime search dans vos préférences Primegrid. Le challenge débutera le 12 juin 2008 à 0:00 UTC pour prendre fin le 13 juin 2008 à 0:00 UTC. Des applications Linux 32 bits et Windows 32 bits sont disponibles. Les personnes sous un système d'exploitation 64 bits recevront une application 32 bits (comme sur tous les projets LLR, le 64 bits n'apporte aucun surplus de puissance par rapport au 32 bits).
Pour connaitre l'heure UTC, cliquez ici.

URL du projet : http://www.primegrid.com/ - INSCRIPTION
Rejoindre L'Alliance Francophone (Join team)

Information sur l'attribution des points lors de ce challenge :

Deux classements seront établis pour les participants individuels et les équipes. Seules les unités reçues après le 12 juin 00:00 UTC puis calculées et réexpédiées au serveur avant le 13 juin 2008 00:00 UTC seront prises en compte pour le challenge. Comme toutes les unités ont le même exposant ⁿ (333.333) et rapportent le même nombre de points, les points BOINC seront utilisés pour établir le classement.

La page qui présente l'avancement des recherches menées sur le projet FightAids@home a été actualisée :

http://fightaidsathome.scripps.edu/status

Le dernier point sur le projet a été effectué il y a 6 mois (voir ici),  depuis les expériences 14, 15 et 16 ont été calculées en totalité. L'expérience 17 (unités faah3145 à 3201) est terminée à 88%, mais elle a été interrompue suite à la découverte d'une erreur dans le code de l'application (pour plus d'explication voir le détail de l'expérience 18 qui est également suspendue à 55%).

Avec toutes ces nouvelles expériences, il devrait y avoir assez d'unités à calculer sur Fightaids@home au mieux jusqu'au mois de décembre 2010.

Expérience 22 (0%), unités faah4417 à 4622 : Cette expérience utilise la méthode "Relaxed Complex", elle est extrêmement similaire à l'expérience 21, mais cette fois, au lieu les amarrer (docking) sur le site actif du VIH, un tiers des composés du programme de développement thérapeutique américain (Developmental Therapeutics Program) seront amarrés à un site inhibiteur allostérique à la surface du VIH ("l'exo site") (l'objectif est de déformer une des enzymes du VIH pour rendre le virus inactif, les enzymes du VIH ont pout fonction de transcrire l'ARN viral en ADN viral, d'intégrer cet ADN viral à l'ADN cellulaire et de participer à l'assemblage du virus). Ces composés seront également amarrés à une sélection de conformations obtenue par décomposition QR à partir de la protéase du VIH mutant V82F/I84V multi résistante aux antirétroviraux. Vous pouvez vous reporter à la description des expériences 21 et 22 pour avoir une définition de la "méthode QR".