1. SIMAP : 2 millions de nouvelles séquences environnementales
(Actualités/SIMAP)

Nouvelles unités de travail (UT) : Nous avons pu préparer les nouvelles UT pour les 2 millions de séquences environnementales des lots de pré-traitement une semaine plus

2. SIMAP : Plus d’unités de travail pour le mois d'août
(Actualités/SIMAP)

...’intégration des séquences pré-traitées dans la base de données SIMAP principale. Cela fera partie du prochain lot qui commencera le 1er septembre. ...

3. SIMAP : Nouvelles unités de travail
(Actualités/SIMAP)

  Le calcul des similarités et caractéristiques des nouvelles séquences importées en juillet 2008 des bases de donn&eacute

4. SIMAP : 130.000 nouvelles séquences à analyser
(Actualités/SIMAP)

...verselle) du 1er juillet. Au vu des calculs à effectuer, il devrait être possible d'obtenir des unités Simap au cours des 5 prochains jours, ensuite il faudra attendre le 1er août pour charger de n...

5. 400.000 nouvelles séquences issues de la base Ensembl à analyser sur SIMAP
(Actualités/SIMAP)

...n provenance de la base de données Ensembl vont être analysées ce mois-ci sur Simap. Elles viennent s'ajouter aux 150.000 séquences issues des bases de donné...

6. Nouvelles unités SIMAP
(Actualités/SIMAP)

Le calcul des similarités et caractéristiques d’environ 180 000 nouvelles séquences importées en mai 2008 des bases de données PDB, RefSeq et Uniprot comme

7. 250.000 nouvelles séquences à analyser sur Simap
(Actualités/SIMAP)

Le calcul des nouvelles unités simap contenant les nouvelles protéines d'avril 2008 (application simap) et leurs domaines (application hmmer) commencera le 30 avri

8. Durée moyenne d'une unité
(Foire Aux Questions/BOINC)

...ol.net  (malariacontrol.net 5.57) : 41 min Rectilinear Crossing Number (rcross 5.44) : 48 min Simap (BOINCSIMAP simap application 5.10) : 45 min Leiden (trajtou-pt111 5.37) : 43 min M...

9. 350.000 nouvelles séquences à analyser sur Simap
(Actualités/SIMAP)

...3 ou 4 jours, il faudra ensuite attendre le 1er mai avant de pouvoir calculer de nouvelles unités Simap. ...

10. SIMAP : l'élargissement de la base de donnée est terminé pour le moment
(Actualités/SIMAP)

...ts de séquençage environnementaux sont terminés. En important ces données, SIMAP a plus que triplé de taille : de 80 milliards de similarités de séq...

11. SIMAP : 700 000 nouvelles séquences à analyser
(Actualités/SIMAP)

...fois ces calculs terminés, les prochaines unités de travail sont attendues le 1er avril (SIMAP redeviendra un projet périodique). ...

12. Une énorme quantité de donnée à analyser sur SIMAP
(Actualités/SIMAP)

  Le projet SIMAP a actuellement besoin de puissance de calcul, un peu plus de 11 millions de fragments d'ADN génomique environnementaux issus de différents

13. SIMAP : 80 000 nouvelles séquences à analyser
(Les Infos/Les Projets BOINC)

Le calcul de la similarité (application simap) et le classement par domaine (application hmmer) de 80 000 nouvelles séquences importées en Octobre des bases de données PDB

14. Projet Lattice : choix de l'application
(Les Infos/Les Projets BOINC)

...ute;s (HMMs) ). C'est exactement le même travail qui a été réalisé sur Simap. MARXAN : Ce programme est utile pour sélectionner une réserve na...

15. Nouveau portail pour la base de données SIMAP
(Actualités/SIMAP)

...ectuer des recherches à l'intérieur de la base de données résultant des calculs sur SIMAP. http://mips.gsf.de/simap Le nouveau portail fournit des outils plus efficaces, l'int...

16. SIMAP : 85 000 nouvelles séquences à analyser
(Actualités/SIMAP)

Le calcul de la similarité (application simap) et le classement par domaine (application hmmer) de 85 000 nouvelles séquences importées en Septembre des bases de donn&eacu

17. Domaine de recherche des projets
(Foire Aux Questions/BOINC)

...ar une civilisation extraterrestre.   Base de donnée sur les protéines SIMAP : Base de donnée sur les similitudes et des domaines des protéines. ...

18. SIMAP : 250 000 nouvelles séquences à analyser
(Actualités/SIMAP)

Le calcul de la similarité (application simap) et le classement par domaine (application hmmer) de 250 000 nouvelles séquences importées en Août des bases de donn&ea

19. Points attribués par Heure de calcul
(Foire Aux Questions/BOINC)

...) : 42,83 QMC@home (QMC@home-preRC1 5.01) : 40,36 PrimeGrid - LLR (TPS) 5.07 :  39,69 Simap (BOINCSIMAP hmmer application 5.09) : 33,66 Riesel Sieve Project (llr 5.20) : 3...

20. Délai de retour des unités
(Foire Aux Questions/BOINC)

...blème du Voyageur de Commerce : 7 jours Project Neuron : 7 jours Proteins@Home : 7 jours Simap : 7 jours Spinhenge@Home : 7 jours Tanpaku : 7 jours VTU@Home : 7 jours Enigm...

21. SIMAP fournit des données pour Gene3D
(Actualités/SIMAP)

Message du 13/08/07 traduit du site du projet SIMAP : SIMAP a commencé à fournir mensuellement des similarités pour les protéines à grande échelle e

22. Puissant serveur de stockage pour SIMAP
(Actualités/SIMAP)

Message du 13/08/07 traduit du site du projet SIMAP : SUN Microsystems a choisi SIMAP comme bénéficiaire d’une Academic Excellence Grant (Subvention d’excel

23. SIMAP : 112.000 séquences de génomes fongiques à classer
(Actualités/SIMAP)

...cute;s, ce qui accélérera le processus de mise à jours de la base de données SIMAP. Cette méthode a été proposée par des utilisateurs du projet ...

24. Les points de sauvegarde et leur fréquence (checkpoint)
(Foire Aux Questions/BOINC)

... SETI@home (SETI@home Enhanced 5.27) SETI@home Beta test (SETI@home Enhanced Enhanced 6.00) SIMAP (Hmmer@home 5.09) Superlink@Technion (Superlink via monitoring load daemon 1.14) ...

25. 200 000 nouvelles séquences à analyser
(Actualités/SIMAP)

Le calcul des similitudes (application simap) et des domaines (application hmmer) de 200 000 nouvelles séquences importées en juillet des bases de données PDB, Uniprot et

26. Configuration minimale recommandée (Mémoire Vive)
(Foire Aux Questions/BOINC)

...Mo) - Orbit@home : SurveySimulator 1.32 (18,1 Mo) - PrimeGrid : GCW Sieve 1.06 (19,6 Mo) - Simap : BOINCSIMAP simap application 5.10 (21,6 Mo) - Leiden : Classical 5.52 (22,5 Mo) -...

27. Fiocruz Genome Comparison (WCG)
(Les Projets BOINC/Terminés)

...cute; scientifique dans sa globalité. A noter que le but du projet est le même que pour Simap, il n'y a que la méthode qui diverge. Simap utilise l'algorithme FASTA, alors que ...

28. Réplication des unités
(Foire Aux Questions/BOINC)

...assical NQueens Project PrimeGrid Proteins@home Riesel Sieve (llr) Seti@home Simap Tanpaku   Deux Docking@home Malariacontrol.net Spinhenge@...

29. Reprise des calculs sur SIMAP
(Les Infos/Les Projets BOINC)

La distribution d'unités SIMAP vient de commencer. 90 460 unités sont à calculer, le stock ne devrait donc pas durer très longtemps. Si vous voulez suivre l'

30. 127 000 nouvelles séquences à calculer
(Actualités/SIMAP)

Le calcul des similitudes (application simap) de 127 000 nouvelles séquences importées en juin des bases de données PDB, Uniprot et RefSeq débutera demain, samedi 30

31. Statut des projets
(Foire Aux Questions/BOINC)

...ent) Predictor@Home (Non recommandé) (lâchers très périodiques) SIMAP (des unités sont à calculer les premiers jours de chaque mois. Mise &agra...

32. Projets avec un code source ouvert
(Foire Aux Questions/BOINC)

...me du Voyageur de Commerce Magnetism@home Riesel Sieve Seti Simap ufluids   BOINC : code source de la plateforme ...

33. Lattice Project : optimisation de l'application HMMPfam
(Les Infos/Brèves)

...ws. L'amélioration a pu être mise en place grâce à Thomas Rattei du projet Simap, qui a partagé le code source de sa propre application hmmpfam. Description ...

34. Comparaison entre les projets SIMAP et HMMPfam (Lattice Project)
(Actualités/SIMAP)

...u près la même chose. Nous sommes actuellement en discussion avec l'équipe du projet SIMAP pour voir comment nous pourrions utiliser leurs résultats pour éviter de ca...

35. Reprise des calculs sur SIMAP
(Actualités/SIMAP)

La distribution d'unités SIMAP vient de commencer. Elles correspondent au calcul des similitudes (application simap) de 33.000 nouvelles séquences importées en mai de

36. Choisir en fonction du lieu géographique du projet
(Foire Aux Questions/BOINC)

... (centre de recherche de Karlsruhe) QMC@home (Université de Münster) SIMAP (Université technique de Munich - MIPS) Spinhenge (Universi...

37. Mise à jour du mois de mai
(Actualités/SIMAP)

Reprise des calculs ce lundi soir Calcul des similitudes (application simap) pour environ 350 000 nouvelles séquences, importées en avril des bases de données PDB, Un

38. SIMAP - Mise à jours du mois de Mars
(Actualités/SIMAP)

...omme d'habitude comparées par rapport à la totalité de la base de donnée SIMAP. N'oubliez pas de préparer vos caches, les unités vont vite parti...

39. En bref
(Les Infos/Brèves)

...eurs qui ensuite éliminent une ou plusieurs paires k et n de la recherche des nombres de Riesel Simap : quelques milliers d'unités sont encore disponibles mais plus pour très lo...

40. SIMAP - reprise des calculs
(Actualités/SIMAP)

...(Hmmer) sont distribués en ce moment même. Les 1er et 4 février plus d'unités Simap et Hmmer suivront, en raison de problèmes techniques, ces unités n'ont pas ...

41. World Community Grid - 5 Janvier 2007
(Actualités/WCG)

...irus» Interactions entre Genome Comparison et FightAids@Home Les différences entre Simap et Genome Comparison   Le projet Genome Comparison peut-il aider le projet ...

42. Simap : du travail pendant quelques jours
(Actualités/SIMAP)

Document sans nom Les 70.000 nouvelles unités (simap 5.10) contiennent environ 200.000 nouvelles séquences issus des bases de données UNIPROT, RefSeq, PDB et

43. Mises à jours Simap
(Actualités/SIMAP)

...se à jour de la base de donnée des domaines de protéine InterPro, les chercheurs de Simap se doivent d'adapter leur systeme à InterPro 14.0.La mise à jour mensuelle ...

44. Nouvelle mise à jour de la base de donnée SIMAP
(Actualités/SIMAP)

De nouvelles unités Simap vont être disponibles à partir du 2 décembre au matin. Les 30.000 unités vont vite partir, elles contiennent environ 65.000 séquence

45. Fiocruz Genome Comparison
(Actualités/WCG)

... rendre sur son compte World Community Grid . A noter que le but du projet est le même que pour Simap, il n'y a que la méthode qui diverge. Simap utilise l'algorithme FASTA, alo...

46. SIMAP - reprise des calculs
(Actualités/SIMAP)

La matrice des similitudes Simap est actuellement à jour Le calcul de nouvelles unités Simap contenant les nouvelles protéines de novembre 2006 commencera autour du 1er d&ea

47. Coopération entre les projets SIMAP et ROSETTA
(Actualités/Rosetta@home)

Document sans nom Deux messsages du Dr Rattei, scientifique du projet Simap, dans lesquelles il évoque la possibilité d'une coopération entre les 2 projets Sur l

48. SIMAP devient un projet périodique
(Actualités/Rosetta@home)

...s bases de données des similitudes et des domaines de protéine sont presque à jour. SIMAP va maintenant se concentrer sur la mise au point de nouvelles métodes bio-informat...

49. Actualité du 18 septembre
(Actualités/SIMAP)

...e;rer que les crédits spécifiques par unités sont un nouveau dispositif de BOINCSIMAP, donc nous sommes intéressés par vos réaction et les suggestions d...

50. SIMAP
(Actualités/SIMAP)

Document sans nom Rallongement des unités hmmer