Le projet Proteins@home
pourrait distribuer les
premières unités de sa troisième phase
de calcul à partir des toutes dernières semaines
de
l'année 2008. Le projet de lutte
contre la dystrophie
musculaire (Help Cure Muscular Dystrophy) devrait quant
à
lui remettre, dans les semaines à venir, le code de sa
nouvelle application (MAXDO) aux techniciens du World Community Grid.
L'adaptation de MAXDO aux normes de la grille de calcul
partagé
gérée par IBM pourrait prendre 4 à 5
mois, le projet devrait donc débuter début 2009.
Le projet Proteins@home
reprendra avant la fin de l'année
Les premières
unités de la troisième phase du
projet Proteins@home devaient être distribuées fin
décembre 2008. Cette phase de calcul
s'intéressera plus
particulièrement aux variations à
l'intérieur de quelques domaines
SCOP (Structural
Classification Of Proteins ; classification structurale des
protéines) plutôt qu'aux
variations entre les domaines SCOP.
Aider à
vaincre la dystrophie musculaire (Help Cure Muscular Dystrophy)
Traduction
du message d'Alessandra Carbone sur le forum
du projet
L'analyse
des données
issues de la première phase du
projet est maintenant terminée, nous serons
bientôt
en mesure de lancer la deuxième phase du projet !
Nous
avons réussi à obtenir une très bonne
complémentarité
entre JET et
MAXDO (JET est un programme de prédiction des sites de
liaison,
et MAXDO est un programme de docking moléculaire
adapté au calcul partagé). Cette bonne
complémentarité réduira
considérablement le
nombre de
liaisons moléculaires qui seront
calculées entre
chaque protéine.
Le
code de l'application MAXDO
sera finalisé dans les prochaines
semaines puis il sera remis aux techniciens du World Community Grid,
dans environ 3 semaines. Cela ne signifie pas que l'équipe
du
World Community Grid sera en mesure de travailler dessus
immédiatement, ils devront faire en fonction de leur
emploi
du temps. Dès qu'ils auront reçu le code, ils
pourront
communiquer une date approximative pour le début de la
seconde phase du projet.
Dans
le même temps,
nous portons les dernières retouches
à la liste des protéines qui seront
utilisées pour
les liaisons moléculaires de la phase II et nous allons
faire
tourner JET sur nos propres machines pour détecter les sites
de
liaison potentiels. Ces calculs permettront un premier
filtrage des données de l'application MAXDO, ils
réduiront le
nombre des liaisons moléculaires qui devront être
calculées à l'aide du calcul partagé.
Je
tiens à vous
remercier pour l'intérêt que vous avez
montré au cours des derniers mois et pour la
puissance de calcul que vous avez offert auparavant. Nous sommes
impatient de
travailler avec vous.
Cet article a été publié le 22-09-2008 00:25. Vous pouvez suivre les commentaires suscités par cet article grâce au fil RSS 2.0. Vous pouvez laisser un commentaire.
Dernière mise à jour 23-09-2008 20:53
Vos commentaires (1)
Posté par tomcat4ever 26-09-2008 16:39,
...
atteind d'une dystrophie musculaire, c'est avec impatience et joie que je lis cet article
