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Ecrit par Heyoka, le 18-07-2006 21:03

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Publié dans : Les Projets BOINC, Sciences de la Vie


La 2ème phase du projet est terminée, la 3ème et dernière phase débutera à la rentrée 2008
proteins

INSCRIPTION win

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URL du projet : http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/

 

 

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  • Les résultats : Domaine Publique
  • Début du projet : 15 Septembre 2006
  • Bêta test

 

Documentation :

La séquence d'acides aminés d'une protéine détermine sa structure tri-dimensionnelle, ou "repliement". Inversement, le repliement est compatible avec un nombre grand mais limité de séquences. Identifier ces séquences pour un repliement donné, c'est le "problème inverse du repliement". Nous sommes en train de le résoudre pour un grand nombre de repliements connus (un sous-ensemble représentatif, soit 1500 repliements). L'étape la plus coûteuse consiste à contruire les fonctions d'énergie décrivant chaque repliement. Pour chaque repliement, nous considérons toutes les séquences d'acides aminés possibles. Paradoxalement, c'est faisable du point de vue du temps de calcul, parce que nos fonctions d'énergie sont des "fonctions de paires" (une somme d'interactions entre paires d'acides aminés). Les fonctions d'énergie construites, nous pouvons explorer l'espace des séquences possibles rapidement et efficacement, et retenir les plus favorables. Cette "cartographie" à grande échelle de l'espace des séquences de protéines aura des applications pour la prédiction de structures et de fonctions de protéines, pour comprendre l'évolution des protéines, et pour concevoir de nouvelles protéines. En vous inscrivant, vous aiderez à construire les fonctions d'énergie et vous ferez avancer un problème important de biotechnologie. Pour plus d'informations, voir la documentation technique ou contactez-nous par les Questions-réponses .

 

Ecran de veille :

 


Dernière mise à jour : 03-06-2008 20:57

   
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Tags : protéines, Proteins@home, proteins, École Polytechnique, polytechnique


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Dommage pour un client Linux

Ecrit par: Guepi (Membre) le 21-05-2008 11:44

Dommage pour un client Linux

Ecrit par: Guepi (Membre IP 82.233.180.232) le 21-05-2008 11:44

Voilà !  
Hier, j'ai compris pourquoi le logiciel BOINC ne pouvait pas lancer de calcul sur la machine de la FAC ...  
Nous sommes sur une distribution GNU/Linux, et donc, proteins@home ne fonctionne pas dessus. 
 
Il y a bien la possibilité de calculer par le truchement de Wine, mais ce logiciel n'est pas installé dans les salles de TP. :cry  
 
Donc pas d'unité proteins@home pour moi sur les bêtes de courses de la FAC. :sigh

 

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C'est reparti!

Ecrit par: Rinouf31 (Membre) le 29-01-2008 16:48

C'est reparti!

Ecrit par: Rinouf31 (Membre IP 82.241.246.14) le 29-01-2008 16:48

Après y avoir participé un petit moment, je viens de voir que le projet vient de repartir aujourd'hui même, mardi 29 Janvier 2008. 
Il n'y a déjà plus d'unités à calculer au moment où je poste ce message mais les pages d'accès sont accessibles. 
Le redémarrage se fait en douceur.

 

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