Reprise des calculs : effective depuis le 01 février 2008
INSCRIPTION
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URL du projet : http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/
Plateforme : Windows
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- Les résultats : Domaine Publique
- Début du projet : 15 Septembre 2006
- Bêta test
Documentation :
La séquence d'acides aminés d'une protéine détermine sa structure tri-dimensionnelle, ou "repliement". Inversement, le repliement est compatible avec un nombre grand mais limité de séquences.
Identifier ces séquences pour un repliement donné, c'est le "problème inverse du repliement". Nous sommes en train de le résoudre pour un grand nombre de repliements connus (un sous-ensemble représentatif, soit 1500 repliements). L'étape la plus coûteuse consiste à contruire les fonctions d'énergie décrivant chaque repliement. Pour chaque repliement, nous considérons toutes les séquences d'acides aminés possibles. Paradoxalement, c'est faisable du point de vue du temps de calcul, parce que nos fonctions d'énergie sont des "fonctions de paires" (une somme d'interactions entre paires d'acides aminés). Les fonctions d'énergie construites, nous pouvons explorer l'espace des séquences possibles rapidement et efficacement, et retenir les plus favorables.
Cette "cartographie" à grande échelle de l'espace des séquences de protéines aura des applications pour la prédiction de structures et de fonctions de protéines, pour comprendre l'évolution des protéines, et pour concevoir de nouvelles protéines. En vous inscrivant, vous aiderez à construire les fonctions d'énergie et vous ferez avancer un problème important de biotechnologie. Pour plus d'informations, voir la documentation technique ou contactez-nous par les Questions-réponses .
Ecran de veille :
Dernière mise à jour : 02-02-2008 16:25
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C'est reparti!
Ecrit par: Rinouf31 (Membre) le 29-01-2008 17:48