Nous commencons un nouveau type d'unités qui ont pour nom SYMM_FOLD_AND_DOCK. Ce sont des unités de travail "extravagantes" -- vous verrez deux chaînes de protéine se secouer et danser l'une autour de l'autre. Nous essayons de prévoir les structures des protéines qui forment des multimères symétriques (une catégorie qui inclut beaucoup de protéines comprenant l'enveloppe des virus et des protéines qui modulent la transcription de l'ADN). Précédemment vous avez pu voir le pliage d'une chaîne, et l'assemblage moléculaire de deux chaînes structurées, mais c'est la première fois que nous explorons simultanément le pli et l'orientation relative des chaînes. C'est un énorme domaine conformationel à explorer, et ceci est possible avec Rosetta@home.
Une première application de ce nouveau protocole est une cible structurale de génomique (s036) afin de « phaser » des données cristallographiques (mettre les atomes à leurs places) -- voir le post de Ingemar
Cet article a été publié le 05-04-2007 21:15. Vous pouvez suivre les commentaires suscités par cet article grâce au fil RSS 2.0. Vous pouvez laisser un commentaire.
Dernière mise à jour 25-09-2008 20:05
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