* SIMAP hmmer est une véritable application BOINC, avec des points de reprise des calculs, un pourcentage de progression des calculs et un certain nombre de modifications du code pour améliorer les performances d'entrée/sortie.

* Lattice HMMPfam est une application BOINC enveloppante, avec pratiquement aucun changement au code hmmpfam.  

* SIMAP hmmer est utilisé pour calculer des séquences Pfam pour toutes les séquences de protéines disponibles dans les bases de données de séquences de protéines.

* Lattice HMMPfam est utilisé pour calculer les séquences Pfam pour toutes les séquences protéiniques des bactéries issues des bases de données publiques de séquences de protéines, ainsi qu'une série de prédictions issues de Glimmer3 pour le génome bactérien. [ C'est la source de la série d'unités qu'il faut traiter actuellement]. Si vous le désirez, je serai enchanté de vous expliquer pourquoi l'ajout des prédictions de Glimmer3 est utile.

* Les 2 projets utilisent des paramètres légèrement différents vis à vis de l'application hmmpfam sous-jacente. Nous ne savons pas si ces légères différences seront significatives ou non.

* Le projet SIMAP semble très orienté vers ses 2 applications. Le but de Lattice (d'après ce que j'en sais, voir Mike et Adam pour la ligne de conduite officielle :-) semble plus être d'assister de nombreuses applications différentes se centrant sur la bioinformatique. HMMPfam est la première application de données lourdes pour Lattice, et en tant que telle, ne calcule pas seulement des choses utiles pour moi :-), mais aussi pour aider le projet Lattice à améliorer son infrastructure générale à supporter ces types d'applications bioinformatiques.