Projet allemand de
prédiction de la structure des protéines par
l'utilisation de l'hypothèse "thermodynamique" de Anfinson
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Boinc (tutorial)
URL du projet : http://boinc.fzk.de/poem/
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Groupe
de prédiction des structures moléculaires,
centre
de recherche de Karlsruhe
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Cette figure représente
la structure prédite (en rouge) et la structure
d'expérimentation (en vert) de la protéine de
choc thermique
bacillus subtilus, un
domaine de fixation universel des acides nucléiques. Ces
protéines ont un rôle important dans la
régulation des gènes suite à un stress
environnemental.
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Les protéines
jouent un rôle de "machinerie" nanométrique dans
toutes les vies cellulaires actuellement connues. Ces
bio-molécules composées de plus de 100.000 atomes
se replient dans des formes géométriques uniques
sous lesquelles elles peuvent assurer leur fonction.
La chimie cellulaire (métabolisme),
la transformation de l'énergie lumineuse (photosynthèse),
le transport (transport
de l'oxygène), le traitement des signaux dans le
cerveau (neurones),
les
réponses immunitaires et bien d'autres font partis
des fonctions possibles d'une protéine. Ces fonctions sont
effectuées avec une efficacité encore
inégalée par n'importe quel processus construit
par l'homme. Le dysfonctionnement d'une protéine est souvent
lié à une maladie et des milliers de
protéines de ce type ont été
identifiées à ce jour, beaucoup ont encore une
structure inconnue.
Pour comprendre, manipuler et
même modéliser les protéines, nous
devons étudier leur structure, ce qui, au niveau de
l'expérimentation, est beaucoup plus difficile que d'obtenir
des informations sur la composition chimique d'une protéine (séquençage).
En rejoignant ce projet, vous
contribuerez à une approche informatique pour :
- Prédire la structure biologiquement active d'une
protéine.
- Comprendre le mécanisme du traitement des
signaux lorsque les protéines communiquent entre elles.
- Comprendre les maladies liées au
dysfonctionnement ou à l'agrégation des
protéines.
- Développer de nouveaux médicaments
sur la base de la structure 3D des protéines importantes du
point de vue biologique.
POEM@HOME met en pratique une nouvelle
approche pour comprendre ces questions liées aux structures
des protéines. Cette approche se prête
parfaitement au calcul
distribué mondial. L'approche scientifique de
POEM@HOME est construite sur une application informatique de
l'hypothèse "thermodynamique" qui fut l'objet du prix Nobel
de chimie remporter par Christian
Boehmer Anfinsen en 1972.
Merci de nous aider en rejoignant
POEM@HOME, afin de résoudre les mystères
scientifiques décrit ci-dessus et déchiffrer les
informations biologiques encodées par les
protéines de structure inconnue.
POEM@HOME est un projet purement
universitaire et sans aucun but lucratif qui a pour but
d'améliorer notre compréhension des structures et
des fonctions bio-moléculaires. Tous les
résultats significatifs réalisés par
POEM@HOME seront évalués par des pairs et
publiés dans des journaux internationaux (voir les
précédentes publications) avec mention
de la participation des volontaires à POEM@HOME.
Dernière mise à jour : 12-01-2008 17:49
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