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SIMAP : 130.000 nouvelles séquences à analyser Convertir en PDF
 

ImageLe calcul des similarités et des caractéristiques d'environ 130 000 nouvelles séquences importées en juin 2008 des bases de données PDB, GenBank et Uniprot débutera dans la soirée (heure universelle) du 1er juillet. Au vu des calculs à effectuer, il devrait être possible d'obtenir des unités Simap au cours des 5 prochains jours, ensuite il faudra attendre le 1er août pour charger de nouvelles unités.

Plusieurs membres de l'équipe du projet assisteront à une conférence scientifique qui se tiendra cette semaine au Danemark, ce qui pourrait retarder l'envoi des nouvelles unités.

Cette nouvelle série de calcul sera aussi l'occasion de tester le nouveau système de "quotas dynamiques". Tous les ordinateurs débuteront avec le même quota journalier, ensuite le nombre d'unités distribuées journalièrement à chaque ordinateur dépendra de sa rapidité pour calculer et retourner les unités. Ce nouveau système devrait permettre de fluidifier l'amorce de chaque nouvelle série d'unités, en évitant la saturation chronique des serveurs du projet.

Vous pourrez faire part de vos observations et de vos impressions à propos de ce nouveau système sur le forum.


30-06-2008 12:58 Heyoka
Cet article a été publié le 30-06-2008 12:58. Vous pouvez suivre les commentaires suscités par cet article grâce au fil RSS 2.0. Vous pouvez laisser un commentaire. Dernière mise à jour 01-07-2008 16:58
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