AccueilSIMAP SIMAP : 130.000 nouvelles séquences à analyser
SIMAP : 130.000 nouvelles séquences à analyser
Le calcul des similarités et des caractéristiques
d'environ 130 000 nouvelles séquences importées en juin 2008 des bases
de données PDB, GenBank
et Uniprot
débutera dans la soirée (heure universelle) du 1er
juillet. Au vu des calculs à effectuer, il devrait être possible
d'obtenir des unités Simap au cours des 5 prochains jours, ensuite il faudra attendre le 1er
août pour charger de nouvelles unités.
Plusieurs membres de l'équipe du projet assisteront à une
conférence scientifique qui se tiendra cette semaine au Danemark, ce
qui pourrait retarder l'envoi des nouvelles unités.
Cette nouvelle série de calcul sera aussi l'occasion de tester
le nouveau système de "quotas dynamiques". Tous les ordinateurs
débuteront avec le même quota journalier, ensuite le nombre d'unités
distribuées journalièrement à chaque ordinateur dépendra de sa rapidité
pour calculer et retourner les unités. Ce nouveau système devrait
permettre de fluidifier l'amorce de chaque nouvelle série d'unités, en
évitant la saturation chronique des serveurs du projet.
Vous pourrez faire part de vos observations et de vos
impressions à propos de ce nouveau système sur le forum.
Cet article a été publié le 30-06-2008 12:58. Vous pouvez suivre les commentaires suscités par cet article grâce au fil RSS 2.0. Vous pouvez laisser un commentaire.
Dernière mise à jour 01-07-2008 16:58
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