Terminés/Suspendus
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- Écrit par : Heyoka
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Au cours des dernières semaines, l'application spider et le serveur du projet ont parfaitement fonctionné. Avec l'aide des participants, et au cours de la dernière quinzaine, plus de 5,5 millions de domaines ont été visités, l'ensemble du trafic internet généré a atteint 2,5 Terabytes. Depuis son lancement, en janvier 2007, spider a déjà visité 16 millions de domaines et plus de 560 millions de pages internet.
La nouvelle application spider 5.27 est plus efficace que les précédentes versions, elle a ainsi permis de diviser par 4 l'utilisation moyenne en mémoire vive. La prochaine étape consistera à améliorer le code du serveur du projet, puis il sera temps de débuter les premiers tests en interne en vue du lancement de la deuxième phase du projet. (l'analyse des données collectées lors de la première phase, et notamment l'étude des liens entre les différents domaines internet)
Le projet du serveur sera hors ligne durant les deux prochaines semaines, le temps d'effectuer ces préparatifs.
Activité du projet au cours des 8 derniers mois : http://www.depspid.net/project_activity.php
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- Écrit par : Modesti
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Les calculs de nouvelles unités simap contenant les nouvelles protéines rendues publiques en mars 2008 et leurs domaines (application hmmer) reprendront le 1er Avril
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- Écrit par : Heyoka
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Nous suggérons aux participants qui calculaient exclusivement sur primegen de sélectionner un autre sous-projet pour continuer les calculs. Les projets de criblage (Sieve), Generalized Cullen/Woodall Sieve et Prime Sierpinski Problem Sieve, ont à peu près les même caractéristiques que primegen, et se présentent comme de bons projets de substitution. Ce choix est à faire dans ses préférences PrimeGrid (Edit PrimeGrid preferences)
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- Écrit par : Heyoka
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La fin du projet OGR-25 est estimée pour le mois Septembre 2008. C'est donc dans 7 mois que l'on devrait prouver ou rejeter par le calcul l'hypothèse proposée en 1984 par deux mathématiciens de l'Université Carlton d'Ottawa (Canada), M. D. Atkinson et A. Hassenklover :
Ordre
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Longueur
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Marques
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25
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480
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0 12 29 39 72 91 146 157 160 161
166 191 207 214 258 290 316 354 372 394 396 431 459 467 480
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- Écrit par : Heyoka et xipehuz
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Chimique Quantique
:
http://pubs.acs.org/cgi-bin/abstract.cgi/jpcafh/asap/abs/jp077592t.html
Vers la Résolution de l'Equation de Schrödinger Electronique pour les Interactions Moléculaires Non-covalentes: Calculs Monte Carlo Quantique à l'Aide de l'Informatique Distribuée.
Martin Korth, Arne Lüchow, et Stefan Grimme
Institut de Chimie organique, Université de Münster, Corrensstrasse 40, D-48149 Münster, Allemagne et Institut de Chimie-Physique, Ecole supérieure polytechnique de Rhénanie-Westphalie,D-52056 Aix-la-Chapelle, Allemagne.
"Les calculs Monte Carlo Quantiques (QMC) sur les complexes de paires de bases adénine/thymine (A/T) et cytosine/guanine (C/G) empilées (st) et en conformation de Watson/Crick (wc) ont été rendus possible grâce au premier projet de calcul distribué à grande échelle avec des méthodes de chimie quantique ab-initio, Quantum Monte Carlo at Home (QMC@HOME).
Les résultats pour les énergies d'interaction (wc-A/T = 15.7 kcal/mol, wc-C/G = 30.2 kcal/mol, st-A/T = 13.1 kcal/mol, st-C/G = 19.6 kcal/mol) sont tout à fait comparables aux meilleures estimations basées sur la théorie du cluster couplé.
La précision de ces valeurs est corroborée par des calculs sur le "benchmark" (repère) S22 constitué par l'ensemble des systèmes liés non-covalents, pour lesquels nous obtenons une plus petite déviation absolue moyenne de 0.68 kcal/mol. Nos résultats sont en accord avec de précédentes recherches montrant que les énergies d'empilement ont une échelle comparable aux interactions sur le thème des liaisons des atomes d'hydrogène communément discuté. De plus, nous avons montré que QMC peut être une intéressante alternative aux méthodes de fonction d'onde traditionnelles pour les grands systèmes liés non-covalents. Nous avons aussi étudié en détail tous les paramètres techniques des simulations QMC et recommandons une procédure d'optimisation prudente des facteurs de corrélation Jastrow de manière à obtenir des résultats numériquement stables et fiables."