Mindmodeling@home : remerciement des admins du projet
- Détails
- Écrit par : admin projet/jerome C (trad/Polynésia
- Catégorie parente: Actualités
Salut les crunchers !
Je voulais juste prendre un instant pour remercier tous nos bénévoles pour le crunching impressionnant au cours des deux dernièrs mois. Depuis mars, nous avons terminé 75 lots sur plusieurs sujets de recherche différents (par exemple, les études de fatigue, des modèles d'apprentissage intégrées, les observateurs idéaux et les tâches d'attention) créés dans divers langages de programmation (par exemple, C / C + +, Lisp, Python, R). Cela a fourni 26000 jours de calcul en environ 70 jours!!! Cela aurait été impossible sans votre soutien et vos ressources.
Nous aimerions également saisir cette occasion pour remercier nos bénévoles principaux (par crédit moyen récent) :
1. [AF> WildWildWest] RLDF
2. tempo666
3. Shaman
4. STE \ / E
5. GATE
Alors que nos chercheurs ont été occupés à créer, exécuter et analyser des modèles, nos développeurs ont ajouté de nouvelles fonctionnalités et étendu le support.
Voici quelques points sur lesquels nous avons travaillé :
- Visualisation des données intégrée sur le Web pour les chercheurs
- Outils pour l'exécution et l'évaluation des arbres de décision ("Arbres rapides et économes") sur des bénévoles et des ressources parallèles dans le cadre d'un nouveau sujet de recherche
- Support des modèles écrits en Java
- Support de modèle bayésien dans le langage statistique R
- Mise à jour du serveur avec la dernière version de BOINC
Et voici certaines tâches qui se profilent à l'horizon :
- Support des modèles Matlab
- Descriptions des projets associés à chaque lot
- Déploiement du calcul des durées d'exécution moyennes pour cibler plus précisément des unités de travail d'une heure pour les tâches ayant des temps d'exécution variables
- Distribution des serveur à la "Wright State University" pour un téléchargement / upload plus rapide, davantage de mémoire système et d'espace disque, et une meilleure utilisation du CPU
N'hésitez pas à transmettre vos idées, demandes et questions! Et merci encore!
- Affichages : 3349
World Community Grid – Mises à jour importantes
- Détails
- Écrit par : JeromeC
- Catégorie parente: Actualités
(traduit de https://secure.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=302 par Zerzi... heu non, Zerizno)
Résumé
Grace à des siècles de temps d’ordinateurs offerts, des volontaires ont terminé les calculs sur plusieurs projets de recherche populaires. Merci! Mais il y a encore du travail, ainsi que de nouveaux projets et de nouvelles fonctionnalités devant nous!
World Community Grid prouve son intérêt
Au début de l’année, il y avait onze projets tournant sur WCG: un record. Grace aux heures, mois et années données par des volontaires comme vous, plusieurs projets ont complété leurs calculs sur la Grille :
- Le projet Help Conquer Cancer s’est terminé en Mai, environ deux ans et demi avant ce qui était prévu. L’ajout des calculs par GPU a permis cette accélération, et les chercheurs de l’Institut sur le Cancer d’Ontario) scrutent déjà les données brutes fournies par WCG. Nous attendons leurs publications au sujet de découvertes excitantes et utiles dans les mois qui viennent.
- Le projet Help Cure Muscular Dystrophy – Phase 2 a été en phase de validation ces derniers mois, et cette partie est maintenant terminée. Les chercheurs ont reçu les derniers résultats et peuvent maintenant commencer leur analyse.
- Discovering Dengue Drugs Together – Phase 2 a eu un succès d’un autre genre. Les chercheurs ont découvert que la méthode de calcul utilisée pendant la dernière phase du projet ne permettait pas de sélectionner les meilleurs médicaments candidats de manière fiable. Ils ont décidé de suspendre le projet le temps de corriger leur technique. Ils sont cependant en train de tester certains composés identifiés durant la première phase de sélection des médicaments. Bien que ce genre d’incident paraisse frustrant, c’est une partie essentielle de l’avancée de la recherche scientifique et du calcul distribué en particulier.
De plus, deux nouveaux projets, Human Proteome Folding- Phase 2 et Go Fight Against Malaria, seront terminés dans les prochaines semaines. Chacun de ces projets a généré des données précieuses durant leur exécution sur WCG. Pour Go Fight Againt Malaria, alors que la première phase de la recherche est terminée, les chercheurs espèrent démarrer une seconde phase dans le futur. Le projet Human Proteome Folding est une initiative plus importante qui doit s’arrêter du fait de coupures budgétaires. Cependant, grâce à WCG, les chercheurs ont amassé une grande quantité de données – données qui ont été rendues publiques et qui sont déjà utilisées par la communauté scientifique.
- Affichages : 7168
Lire la suite : World Community Grid – Mises à jour importantes
OProject@home
- Détails
- Écrit par : JeromeC
- Catégorie parente: Les Projets BOINC
Infos Utiles :
- Statut : Actif
- Url pour s'y attacher : http:/oproject.info/
- L’alliance Francophone : http:/oproject.info/team_display.php?teamid=4
- Classement mondial de L'AF : http:/boincstats.com/fr/stats/138/team/list
- Temps de calcul et points de sauvegarde : http:/wuprop.boinc-af.org/results.html
- Avancement des sous-projets : http:/oproject.goldbach.pl/
- État du Serveur : http:/oproject.goldbach.pl/server_status.php
- Affiliation : Aucune, projet personnel par Lukasz Swierczewski
- Affichages : 5279
FightMalaria@Home : premier succès
- Détails
- Écrit par : Polynésia/JerômeC (trad)
- Catégorie parente: Actualités
Bonjour à tous,
Les administrateurs du projet annoncent leurs premiers grands succès. Après avoir analysé les données générées dans la première phase (calcul des points d'arrimage des 400 composés MalariaBox avec tous les modèles), ils ont classé les listes des inhibiteurs potentiels pour chaque récepteur.
Mais sont-ils bien réels ? C'est le genre de question qu'ils les empêchent de dormir la nuit, apparemment...
Mais maintenant ils peuvent dormir tranquilles - car ils ont testé les 20 meilleurs candidats en utilisant un modèle de la forme plasmodiale des HDAC (histone déacétylase) dans un laboratoire (Dr Marian Brennan, RCSI, Dublin), et trois nouveaux inhibiteurs ont été trouvés ! Il ne s'agit que de l'un des 1500 récepteurs où ils cherchent les points d'arrimage, en utilisant que les meilleurs résultats d'accueil (CAD seulement les 20 meilleurs ligands).
C'est un résultat fantastique, qu'ils leur donnent de l'espoir que d'autres joyaux n'attendent plus que d'être trouvés dans les données que nous avons générées sur nos ordis !
Bravo à tous!!
PS Ils sont en train d'écrire un manuscrit pour être publié dans une revue à accès ouvert, de sorte que nous soyons en mesure de lire plus en détail et télécharger toutes les données générées à partir de FM@H, une fois qu'ils auront survécu au processus d'examen par les pairs.
- Affichages : 3490
Rejoindre Ibercivis et aider avec le projet Bindsurf
- Détails
- Écrit par : JeromeC
- Catégorie parente: Actualités
Rejoindre Ibercivis et aider avec le projet Bindsurf [Linux / CUDA uniquement pour le moment]
En quoi cela consiste ?
Les méthodes de criblage virtuel (CV) peuvent aider grandement dans le processus de découverte de nouveaux médicaments et la recherche clinique, en prédisant comment les ligands interagissent avec des cibles thérapeutiques déterminées. La plupart des méthodes CV présupposent un seul site de liaison avec la protéine, qui est normalement déduite de l'interprétation des informations cristallographiques disponibles sur la protéine. Toutefois, il a été démontré que cette affirmation est inexacte et que, dans de nombreux cas différents ligands interagissent avec différentes parties de la protéine, et la plupart des méthodes existantes de CV, y compris commerciale, ne tiennent pas compte de cet effet.
Pour résoudre ce problème nous avons développé BINDSURF, une nouvelle méthodologie de CV qui analyse en détail la surface de la protéine pour trouver des zones d'interaction potentielles où les ligand pourraient interagir, et qui a été conçue et mise en œuvre pour du matériel massivement parallèle comme le GPU, ce qui permet de traiter rapidement et efficacement de grandes bibliothèques de ligands.
Les prédictions obtenues avec BINDSURF permettent en plus de diriger leur application ultérieure à d'autres méthodes de CV sur des zones de la protéine déjà caractérisées par cette méthode, et donc son utilisation contribue à la découverte et la conception de médicaments, au repositionnement de molécules et à la recherche clinique.
- Affichages : 3526
Lire la suite : Rejoindre Ibercivis et aider avec le projet Bindsurf
Nouvelle version de boinc
- Détails
- Écrit par : Pascal94/JeromeC/Modesti/Polynésia
- Catégorie parente: Les Infos
BOINC 7.0 est maintenant disponible pour le public. Cette version inclut de nombreuses corrections de bugs et de nouvelles fonctionnalités.
L'équipe de développement tient à remercier tous les testeurs et toutes les personnes qui ont apporté leur soutien au travers des divers projets existants pour leurs efforts inlassables afin de faire de BOINC le meilleur produit possible.
Voici les apports principaux de cette version:
* support des GPU Intel
* Amélioration du planificateur de tâches du client boinc et des stratégies de récupération d'unités de travail
- Affichages : 17453
Page 34 sur 35