WCG - Mapping Cancer Markers : Mise à jour de juin
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- Écrit par : franky82
- Catégorie parente: Actualités
Récapitulatif
Vous cherchez un projet supplémentaire à soutenir ? Veuillez ajouter Mapping Cancer Markers à votre liste.
Contribuez à améliorer les chances des patients atteints de cancer
Contexte
Le projet Mapping Cancer Markers vise à identifier les marqueurs associés à différents types de cancer. Le projet analyse des millions de points de données collectés à partir de milliers d'échantillons de tissus de patients sains et cancéreux. Ceux-ci comprennent les tissus atteints de cancer du poumon, de cancer de l'ovaire et de sarcome.
Jusqu'à présent, le projet a terminé de générer des données sur les marqueurs du cancer du poumon et du cancer de l'ovaire sur World Community Grid. Avec l'aide du temps de calcul continu des bénévoles, les chercheurs étudient maintenant les marqueurs du sarcome, qui est un groupe de cancers qui prennent naissance dans les os, les muscles ou d'autres tissus. Vous pouvez en savoir plus sur les conclusions de l'équipe de recherche à ce jour ici.
L'aide de tous est nécessaire
Mapping Cancer Markers dispose généralement d'un nombre important et constant d'unités de travail, et l'équipe de recherche s'attend à ce que cela se poursuive dans un avenir prévisible. Avec la fin récemment annoncée d'un autre projet World Community Grid, nous demandons aux volontaires qui ne font pas déjà don de puissance de calcul à Mapping Cancer Markers de l'ajouter à leur liste de projets. Vous pouvez vérifier et modifier les projets que vous soutenez ici.
État actuel des unités de travail
- Disponible pour téléchargement : 863 lots
- En cours : 1 251 lots
- Terminé : 75 671 lots
1130 lots au cours des 30 derniers jours
Moyenne de 37,7 lots par jour
- Reste à faire (équipe de recherche) : 22,9 jours
22 juin 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=712
- Affichages : 1222
WCG - Help Stop TB : Mise à jour de juin
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- Écrit par : franky82
- Catégorie parente: Actualités
Récapitulatif
Avec l'ajout récent d'un nouveau membre permanent de l'équipe, les chercheurs peuvent commencer à tirer parti des techniques d'apprentissage automatique pour faciliter l'analyse des données.
Contexte
Le projet Help Stop TB a été créé pour étudier la gaine de Mycobacterium tuberculosis , la bactérie responsable de la maladie. Ces connaissances pourraient aider les scientifiques à mieux comprendre comment la bactérie se protège, ce qui pourrait à son tour aider à la recherche de meilleurs traitements.
En octobre, l'Organisation mondiale de la santé a publié les statistiques mondiales les plus récentes sur la tuberculose, notamment les suivantes :
- En 2019, environ 10 millions de personnes ont contracté la tuberculose.
- 1,4 million de personnes sont décédées de la tuberculose en 2019.
- La tuberculose reste l'une des 10 principales causes de décès dans le monde et la principale cause d'un seul agent infectieux (au-dessus du VIH / SIDA).
Analyse des données
Connor McGee, le plus récent membre de l'équipe de recherche, développe des flux de travail basés sur l'apprentissage automatique pour aider à analyser les données provenant de World Community Grid. L'équipe est en train de finaliser une mise à jour du projet, qui comprendra plus d'informations.
Les chercheurs décident également s'ils combineront leurs découvertes à ce jour en un seul article ou s'ils peuvent en créer deux sur la base des données qu'ils ont actuellement analysées.
État actuel des unités de travail
- En cours : 24 lots (850 unités de travail)
- Terminé : 24 181 lots
59 lots au cours des 30 derniers jours
Moyenne de 2,0 lots par jour
Remarque : pour ce projet particulier, les chercheurs doivent souvent analyser les lots que nous leur renvoyons avant de pouvoir construire plus d'unités de travail. Cela peut parfois conduire à une alimentation intermittente des unités de travail.
16 juin 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=711
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WCG - Africa Rainfall Project : Mise à jour de juin
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- Écrit par : franky82
- Catégorie parente: Actualités
Récapitulatif
Un membre de l'équipe de recherche franchit une étape académique importante ce mois-ci.
Contexte
Grâce au projet Africa Rainfall Project, des chercheurs de l'Université de technologie de Delft créent des simulations informatiques d'orages localisés en Afrique subsaharienne. Grâce à la puissance de calcul massive et participative de World Community Grid, ils peuvent exécuter ces simulations à un niveau de résolution élevé, ce qui est exactement ce qui est nécessaire pour les orages localisés. Cela n'a jamais été fait auparavant pour les pluies torrentielles dans cette région.
Ceci est important car 95 % de l'agriculture en Afrique dépend des précipitations. Le projet utilisera les données générées par World Community Grid, les données de The Weather Company et d'autres informations pour aider à fournir des prévisions de précipitations plus précises. À leur tour, ces prévisions plus précises pourraient aider les agriculteurs à augmenter leurs récoltes avec plus de succès.
Stockage et partage de données
Depuis plusieurs mois, l'équipe de recherche travaille à préparer ses données pour qu'elles soient facilement partagées avec d'autres scientifiques et le public. Étant donné que l'ensemble de données est très volumineux et complexe, ce n'est pas une tâche facile.
Le serveur sur lequel les données du projet seront stockées est maintenant prêt. La prochaine étape sera d'assembler et de déplacer les données. Avec les problèmes de connexion au système pour finaliser le transfert. Pas tout à fait un flux de travail complet - nous devrons déterminer le travail restant.
Etape importante pour un membre de l'équipe de recherche
Camille Le Coz, membre de l'équipe de recherche qui prépare les unités de travail et interprète les résultats, soutiendra sa thèse ce mois-ci. Nous lui souhaitons le meilleur dans cette étape importante !
Statut actuel des unités de travail
Le World Community Grid envoie actuellement la génération 70.
(Une génération est un ensemble de travaux - dans ce cas, un ensemble de simulations informatiques des précipitations en Afrique subsaharienne.)
10 juin 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=710
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WCG - Microbiome Immunity Project : Mise à jour de juin
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- Écrit par : franky82
- Catégorie parente: Actualités
Récapitulatif
Quatre années de puissance de calcul volontaire ont permis de prédire plus de 330.000 structures de protéines. Maintenant, le temps du projet sur World Community Grid touche à sa fin. Mais l'analyse et la publication des données ne font que commencer.
Contexte
Des milliards de bactéries vivent à l'intérieur et sur notre corps. Le projet Microbiome Immunity Project utilise la puissance de calcul du World Community Grid pour étudier les protéines produites par ces bactéries, qui sont codées dans leurs génomes. Cela peut aider les scientifiques à comprendre le rôle du microbiote dans la maladie.
Premier article publié (et d'autres en cours)
L'équipe de recherche a récemment publié un article dans Nature Communications sur les techniques qu'elle a développées à la suite du projet.
Il y a deux autres articles en cours, et les chercheurs nous tiendront au courant de leur statut au fur et à mesure de l'avancement des travaux.
L'avenir du projet
La puissance de calcul des volontaires a aidé l'équipe de recherche à prédire les structures de plus de 330.000 protéines depuis le lancement du projet en 2017. Avec les récents progrès technologiques, il existe désormais des moyens d'analyser ce type particulier de données plus rapidement qu'il n'était possible il y a quatre ans. Par conséquent, le temps du projet sur World Community Grid se terminera dès que les unités de travail actuelles seront terminées.
Merci à tous ceux qui ont contribué à ce projet depuis sa création. Les chercheurs préparent une mise à jour pour nous et nous tiendront informés des futurs articles et découvertes qui pourraient résulter des données.
Vous pouvez lire un article des chercheurs directement sur le forum Microbiome Immunity Project.
Statut actuel des unités de travail
- Disponible en téléchargement : 1 310 lots
- En cours : 3 846 lots (8 420 064 unités de travail)
- Terminé : 331 125 lots (1 368 lots au cours des 30 derniers jours, soit une moyenne de 46 lots par jour)
- Carnet de commandes estimé : 28 jours.
8 juin 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=708
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WCG - OpenPandemics - COVID-19 : Mise à jour de mai
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- Écrit par : franky82
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Récapitulatif
Le projet a ajouté la puissance du GPU à la forte puissance du processeur existante qui prend en charge la recherche de traitements potentiels COVID-19.
Contexte
Le projet OpenPandemics - COVID-19 a été créé pour aider à accélérer la recherche de traitements potentiels contre la COVID-19. Le projet vise également à créer une boîte à outils open source à réponse rapide qui aidera tous les scientifiques à rechercher rapidement des traitements en cas de futures pandémies.
Fin 2020, les chercheurs ont annoncé avoir sélectionné 70 composés (parmi un groupe initial d'environ 20.000) qui pourraient être prometteurs en tant qu'inhibiteurs potentiels du virus responsable de la COVID-19. Des tests en laboratoire sont actuellement en cours pour 25 de ces composés.
Unités de travail GPU
Nous avons récemment terminé les tests bêta et avons publié des unités de travail GPU pour ce projet. Actuellement, le projet envoie 1 700 nouvelles unités de travail toutes les 30 minutes. Nous prévoyons d'envoyer du travail GPU à ce rythme dans un avenir proche.
Nous continuerons de créer et de publier des unités de travail régulières qui utilisent la puissance du processeur. Cela aidera à maintenir le travail à un bon rythme et garantira que tous ceux qui souhaitent apporter une puissance de calcul puissent participer.
Test de résistance de l'infrastructure technique de World Community Grid
Plus tôt ce mois-ci, l'équipe technique de World Community Grid a voulu déterminer la limite supérieure de la puissance de calcul du programme et savoir si l'infrastructure actuelle serait en mesure de supporter la charge si nous fournissions suffisamment de travail GPU pour répondre à la demande.
Les scientifiques d'OpenPandemics - COVID-19 nous ont fourni environ 30.000 lots de travail GPU (soit la quantité de travail effectuée en environ 10 mois par les processeurs), et nous avons laissé ces lots fonctionner jusqu'à ce qu'ils soient complètement traités.
Le test de résistance a duré huit jours, du 26 avril au 4 mai 2021. Merci à tous ceux qui ont participé à cet important test. Nous prévoyons avoir bientôt un message sur le forum de l'équipe technique pour résumer ce qu'ils ont appris sur les capacités et les limites actuelles de World Community Grid.
État actuel des unités de travail
CPU
- Disponible pour téléchargement : 1 322 lots
- En cours : 6240 lots
- Terminé : 44.810 lots
5.596 lots au cours des 30 derniers jours
Moyenne de 186,5 lots par jour
- Reste à faire (équipe de recherche) : 7,1 jours*
*L'équipe de recherche construit plus d'unités de travail
GPU
- En cours : 2391 lots
- Terminé : 37 569 lots
35 296 lots au cours des 30 derniers jours (en grande partie grâce au test de résistance)
Moyenne de 1176,5 par jour (encore une fois, en grande partie grâce au test de résistance)
27 mai 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=705
- Affichages : 1275
WCG - Mapping Cancer Markers : Mise à jour de mai
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- Écrit par : franky82
- Catégorie parente: Actualités
Récapitulatif
Les chercheurs ont procédé à une validation supplémentaire de leurs données sur les marqueurs du cancer du poumon.
Contribuez à améliorer les chances des patients atteints de cancer
Contexte
Le projet Mapping Cancer Markers vise à identifier les marqueurs associés à différents types de cancer. Le projet analyse des millions de points de données collectés à partir de milliers d'échantillons de tissus de patients sains et cancéreux. Ceux-ci comprennent les tissus atteints de cancer du poumon, de cancer de l'ovaire et de sarcome.
Jusqu'à présent, le projet a diffusé des données sur le cancer du poumon et les marqueurs du cancer de l'ovaire sur World Community Grid. Les chercheurs étudient actuellement les marqueurs du sarcome, qui est un groupe de cancers qui commencent dans les os, les muscles ou d'autres tissus. Vous pouvez en savoir plus sur les résultats de l'équipe de recherche à ce jour ici.
Publication à propos des marqueurs du cancer du poumon
Les chercheurs ont effectué plus de travail de validation des données pour publier cet article. La signature sur laquelle ils enquêtent a été bien validée par rapport à différents ensembles de données indépendants avec une variété d'échantillons (tumeur solide, sang, etc.).
État actuel des unités de travail
- Disponible pour téléchargement : 824 lots
- En cours : 1 202 lots
- Terminé : 74 639 lots
1265 lots au cours des 30 derniers jours
Moyenne de 42 lots par jour
- Reste à faire (équipe de recherche) : 19,5 jours
21 mai 2021
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=704
- Affichages : 1148
- WCG - Smash Childhood Cancer - Mise à jour de mai
- WCG - Microbiome Immunity Project : Mise à jour de mai
- WCG - Africa Rainfall Project : Mise à jour de mai
- WCG - Smash Childhood Cancer - Mise à jour d'avril
- WCG - Mapping Cancer Markers : Mise à jour d'avril
- WCG - Microbiome Immunity Project : Mise à jour d'avril
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